Концепцията за Европейска агенция за морска безопасност (ЕАМБ) като регулаторна агенция възниква в края на 90-те години на ХХ в., успоредно с редица други големи европейски инициативи за морска безопасност. ЕАМБ е създадена с Регламент (ЕО) № 1406/2002 като основен източник на подкрепа за Комисията и държавите членки в областта на морската безопасност и предотвратяването на замърсяване от кораби, а с последващите изменения нейният мандат е уточнен и разширен.