Upravni odbor
Upravni odbor nadzoruje delo agencije in izvršne direktorice. Njegova naloga je predvsem, da sprejme enotni programski dokument agencije, ki zajema triletno obdobje, ter na podlagi svoje pristojnosti v okviru proračunskega postopka proračun in kadrovski načrt. Poleg tega sprejme in oceni konsolidirano letno poročilo o dejavnostih agencije, kot je določeno v finančni uredbi, v okviru česar obravnava doseganje ciljev ter rezultate v zvezi z načeli stroškovne učinkovitosti, uspešnosti in dobrega finančnega poslovodenja.
V upravnem odboru so zbrani predstavniki vseh držav članic EU, Islandije in Norveške (državi Efte kot opazovalki) ter štirje predstavniki Komisije in štirje predstavniki brez glasovalne pravice iz različnih sektorjev pomorstva.